解放前无防疫设施，医药落后，倘有瘟疫，无法制止，造成大量死亡。
根据旧志记载：明嘉靖十七年(1538)、清乾隆十三年(1748)、清光绪二十八年(1902)，境内先后发生瘟疫，病情严重，特别是光绪二十八年的瘟疫，死亡1万余人。
民国25年(1936) 5月，永宁乡厚桂村发生瘟疫，发病43人，死亡35人。27年，县城霍乱流行，死亡甚众。35年，县内流行疟疾、痢疾，蔓延至90％的村庄，当年发病9.64万人，死亡0.19万人；同年，天花流行，2至5月统计全县，发病0.19万人，死亡383人。次年，疟疾、痢疾继续流行，患者8.37万人，死亡0.87万人；当年，广西省第三医疗队、卫生部医疗总队第五医疗队曾来县支援，仅在县城治疗，无暇顾及农村。
解放后，县内流行过各种流行性传染病、寄生虫病，以及地方性疾病17种。卫生部门采取各种措施，预防和扑灭这些疾病。现将流行较快、蔓延较广、疫情严重的11种疾病，防治情况记载如后。
天 花
解放前县内每年有流行，死亡率极高。解放后，中共全州县委和县人民政府，组织培训种痘员，免费普遍施种牛痘。1952年12月至次年1月完成98497人的牛痘普种任务。1962年到1964年先后普种了龙水、大西江、才湾、绍水、永岁、庙头、文桥等7个区22.29万人次，占全县总人口的49％。 1965年组织医务人员416人进行普种，计接种29.54万人次。此后每隔5年普种一次， 至1974年完成普种任务37.42万人次。1980年世界卫生组织宣布全世界消灭天花。县内1984年终止接种牛痘。
流行性乙型脑炎
1958年开始有乙脑病例报告， 全年发病3例。1965年6月又出现病例，7月形成高峰，疫情发展到12个区， 1个镇，月发病67例，死亡17例。疫情发生后，县先后组织医务人员20余人， 深入疫区，采取隔离病人治疗和药物灭蚊的综合性防治措施。8月疫情下降，全年发病108例，死亡24例。1969至1973年，由于“文化大革命”的于扰，放松了防疫工作，连续5年出现较大幅度地流行， 5年共发病807例，死亡143例。1975年在全县范围内，接种乙脑疫苗7.63万人， 儿童的免疫能力得到增强， 加之人民生活水平逐年提高，发病率逐年下降。如1964至1974年的11年，每年平均发病107.8例。1975至1985年，年均发病24例。
1986至1990年共接种乙脑疫苗达38万人次，5年共发病106例，死亡7例。
痢 疾
1975年6月，县内部分公社出现痢疾流行，7月达高峰，月发病0.25万例。经组织赤脚医生和不脱产卫生员积极防治，控制了大流行。但全年发病仍达0.91万例，是解放后痢疾发病最多的一年。1978年大西江公社良田大队，5至10月全大队2000人，患痢疾者1510人，死亡3人。疫情发生后，县防疫站、县医院组织医疗队深入疫区，采取发动群众进行饮水消毒、管水、 改水、灭蝇、服预防药等综合性防治措施，疫情渐趋缓和。1986年发生痢疾425例，发病率为61.42/10万。1990年发生676例，发病率为90.6/10万。