清康熙二十八年（1689年）以前，县内行政区划无考。康熙二十八年，全州设6乡及西延巡检司，共74里、56都1保3团（团相当于都的户籍编制单位）其序列为：升乡17里（今文桥、庙头、黄沙河、永岁）辖一都，二都一、二图，三都，四都一、二图，五都一、二图，六都，七都一、二图，八都一、二图，九都一、二图，十都一、二图；恩乡26里（今东山、白宝、两河、朝南、石塘、枧塘、城郊乡一部分），辖十一都，十二都一、二、三、四、五图系瑶族，十三都一、二、三图，十四都，十五都，十六都，十七都一、二图，十八都，十九都，二十都，二十一都，二十二都，二十三都一、二图，二十四都一、二图，二十五都一、二、三图；建乡8里（今安和、蕉江、凤凰乡），辖二十六都，二十七都，二十八都，二十九都，三十都，三十一都，三十二都，三十三都，三十四都；宜乡6里（今咸水、绍水），辖三十五都，三十六都，三十七都，三十八都，三十九都，四十都；长乡7里（含才湾乡、绍水镇的高田、秀石、大渭洞、龙水乡的百福、长井村等），辖四十一都，四十二都，四十三都，四十四都，四十五都，四十六都；万乡10里（今龙水、大西江乡），辖四十七都，四十八都，四十九都一、二图，五十都，五十一都，五十二都，五十三都；雍正七年（1729年）撤西延巡检司置西延分州（今资源县的中峰、延东、梅溪），辖五十五都一、二、三图，五十六都一、二图，西山保，三团。州城划为6隅，即东隅（今东门），南隅（今大南门、小南门），西隅（今板桥头），上北隅（今桂黄北路），下北隅（今朝京路），降源隅（今桂黄中路）。

    清乾隆三十年（1765年），沿康熙时的区划，设乡、里、都、图。图下设村。乡名更改，升乡改升平乡、恩乡改为恩德乡、建乡改为建安乡、宜乡为宜湘乡、长乡为长乐乡、万乡为万全乡，西延分州仍用原名。

    清光绪末年（1908年），全州设8区，即第一区（城厢内外），第二区（升平乡及长乐乡之一部分），第三、第四区（恩德乡），第五区（建安乡），第六区（宜湘乡及长乐乡之一部分），第七区（万全乡），第八区（西延分州）。